Le vin bio est élaboré à partir de raisins cultivés sans pesticides, herbicides ni engrais chimiques de synthèse. La certification Agriculture Biologique (AB) porte principalement sur la vigne. En cave, le vigneron bio peut utiliser des intrants conventionnels mais en quantité limitée, notamment les sulfites qui jouent un rôle de conservateur essentiel.
La biodynamie (certification Demeter ou Biodyvin) va plus loin : elle applique les principes de Rudolf Steiner, utilise des préparations à base de plantes et de minéraux selon le calendrier lunaire, et considère le domaine comme un organisme vivant autonome. Des domaines comme Zind-Humbrecht, Leflaive et la Romanée-Conti pratiquent cette approche avec des résultats remarquables.
Le vin naturel n'a pas de certification officielle mais s'appuie sur des vendanges manuelles, des levures indigènes (sans levurage), une vinification sans intrants et des sulfites ajoutés très faibles voire nuls. Ces vins peuvent présenter des déviations organoleptiques (vin trouble, légèrement pétillant) qui font partie de leur charme pour leurs amateurs.